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TCR-seq是什么?

TCR是什么?


T细胞受体(T-cell receptor),简称TCR,是在T细胞表面的一种分子,T细胞介导的抗原识别依赖于TCR与抗原-主要组织相容性复合体(MHC)相互作用(如下图)。当TCR、抗原肽、MHC结合时,T淋巴细胞通过信号转导被激活,进入后续的免疫应答过程。

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TCR是高度多样化的异源二聚体,人类约95%的T细胞表达α链和β链(αβ-TCR,两条链分别由TRA和TRB编码),外周血T细胞(约占1–5%)与粘膜位置T细胞还会表达γδ链(γδ-TCR,分别由TRG和TRD编码),当身体处于肿瘤或疾病状态下,αβ-TCR和γδ-TCR比例会发生变化。



TCR的特征

TCR复合物的基本功能是引导T细胞识别特定的抗原。面对多种多样的抗原类型T细胞是如何做到“特异”识别的呢?这就归功于TCR的“高度多态性”了。


TCR α链和β链是由一系列可变(variable, V)和连接(joining, J)基因编码的,TCR β和γ链由高变(diversity,D)基因编码。


TCR多态性是基于RAG1和RAG2重组酶的V-(D)-J重组过程中,V、D、J中一个随机等位基因会与其他区段等位基因重组。在V-D、D-J与V-J基因片段之间的连接点处会随机进行核苷酸的添加、缺失。


此外,在转录过程中位于重组V(D)J区域的序列以及恒定(Constant, C)区域的基因序列会进行可变剪切,形成存在一定功能差异的转录本。该过程会形成超多的重组与结合多样性,产生多种多样的TCR。


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为什么研究TCR?

通过TCR谱可以分析个体T细胞中全部TCR信息,当个体处于疾病发生发展中时TCR谱会产生巨大变化,所以研究者对疾病状态下患者的免疫组库特别感兴趣。


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