想扩增子测序和宏基因组测序一样，我们在做完蛋白质组之后，也是需要将原始数据上传到公共数据库中的，今天给大家介绍一下蛋白质组数据上传的流程。

数据库

目前储存蛋白质组数据的公共数据库有好几个，我们选择ProteomeXchange作为本次示例的上传数据库。

上传工具下载

进入数据库网站，点击Submit Data，进入上传数据页面。

点击downloaded下载数据上传工具。

数据上传

下载后的数据上传工具是一个压缩包，首先要保证电脑安装有java，之后解压缩下载工具，双击px-submission-tool-2.4.13.jar打开数据上传工具。

首先要注册账号并登陆，没有账号点击Resgister New User进行注册。

点击注册会进入如下界面，点击Register进行注册，注册完成后，密码会发到注册的邮箱中，之后在上传工具中进行登陆。

登陆成功之后，首先需要选择上传模式，我们上传的是原始数据，应当选择Partial Submission模式。

点击NEXT，弹出的界面中选择是。

之后界面中会给出上传所需要的信息，这一步没有操作，只是提示我们需要准备下列信息才能完成数据的上传，点击NEXT即可。

接下来开始填写数据的相关信息，首先需要填写数据的基本信息，包括标题、关键词、项目描述、样品准备方法、数据处理方法和实验类型，将数据相关文章的标题、关键词、摘要和材料与方法填入即可，注意字数限制。

之后需要选择提交的文件，选择pep和prot搜库文件，并选择search类型，原始数据选择raw类型。

之后需要选择搜库文件与原始文件的关联，点击Relation后勾选即可。

之后要填入一些必要的样品和测试信息，比如物种、组织类型、所用质谱仪器等。

如果需要填的信息在下拉列表里没有，则选择最下方的Others，之后在打开的页面中搜索，找到结果后，选中，点击Use Selected Term，注意搜索页面打开后会自行进行连接，需要等待几十秒钟才能进行搜索。

之后需要填入项目负责人的姓名、邮箱和单位地址，地址要包含国家。

之后一步是填写母项目信息，如果上传数据不属于某一个大项目的子项目，则无需填写。

确认信息，要勾选最下方的license。

数据开始上传。

完成后所给的号并不是最终的序列号，最终的序列号需要经过数据库审核之后已邮件形式发送，需要几天时间。