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Science:如何高效阅读文献?

如何高效地阅读一篇论文,从论文中获取有用的知识并抓住要点?

Elisabeth Pain刊登在《Science》上的采访稿“How  to  (seriously)  read  a  scientific  paper”中提供了许多有用的建议。
本文是该文的中文译文。原文链接和被采访对象的身份列在本文末尾。在本文最后还给出了另外两篇关于提高阅读效率的参考文献。
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Adam Ruben 关于阅读科学论文的共同困难和挫折的趣味专栏在《科学职业》的读者中引起了广泛共鸣。我们邀请了十几位处于不同职业阶段和广泛领域的科学家来告诉我们,他们是如何做到的。
结果很明显,随着经验的积累,阅读科学论文变得更加容易,但绊脚石是客观存在的,而每一位科学家都有责任确定并应用最适合他们自身的阅读技巧。为清晰简洁起见,我们对采访回复进行了编辑。




你如何阅读论文?





我从阅读摘要开始,接着我浏览了一下引言,翻阅了这篇文章,看了这些图形。我试着找出最突出的一两个图形,我明白其中表达了什么。然后,我读了结论/总结。只有当我这样做的时候,我才会回到技术细节中去澄清我可能有的任何问题。        
——Jesse Shanahan 

我首先通过阅读摘要和结论得到一个大致的概念。这些结论有助于我理解摘要中总结的目标是否已经实现,以及所描述的工作是否对我自己的研究有意义。我也经常看图表,因为它们会帮助我对一篇论文产生第一印象。然后,我通常从头到尾阅读整篇文章,按照它们出现的顺序浏览各个部分,这样我就可以明确了解作者想要表达的文章内容。如果你想让它成为一个卓有成效的练习,你首先需要清楚地知道你需要获得哪类信息,随后你需要在阅读中把重点放在这方面。这些重点可以是将你(期望看到)的结果与作者提出的结果进行比较,将你自己的分析置于上下文中,或者使用新发布的数据对其进行扩展等。引文列表可以帮助你决定为什么这篇论文与你最相关,给你一个第一印象,让你知道和你做过类似研究的研究者是如何使用这篇论文的。
——Cecilia Tubiana 

如果我的目标是抓住要点,我会阅读摘要,跳到图表并浏览讨论部分的要点。因为论文的摘要和正文可以被作者掌控并进行塑造,从而用来讲述一个引人入胜的故事,所以我认为图表是论文最重要的部分。如果我不清楚这些图形的含义,我就会转向去研究方法论。
如果我想更深入地研究这篇论文,我通常会完整地阅读它,同时也会阅读该作者以前的一些论文或关于同一主题的其他文章。如果在我觉得特别有趣或有争议的陈述之后有参考文献,我也会查找并阅读这篇参考文献。如果我需要了解更多的细节,我可以访问任何额外提供的数据源或补充阅读材料。
如果作者的研究与我的相似,我会看看他们的相关数据是否与我们的发现相符,或者是否有任何不一致的地方。如果有的话,我会考虑导致此种情况的原因。此外,我思考如果我们使用与他们相同的方法,我们的模型会发生什么,以及我们可以从中学习到什么。有时,关注作者决定以某种方式进行实验的原因也很重要。作者是否使用了模糊的测试而不是常规的测试,他们为什么要这样做?        
——Jeremy C. Borniger 

我总是从标题和摘要开始。这会告诉我这是否是一篇我感兴趣的文章,以及我是否能够从科学和语言两方面理解它。随后我读了引言,这样我就能理解被框起来的问题,直接跳到图形和表格上,这样我就能对数据有所理解。之后我阅读讨论部分来了解论文是如何融入知识体系的。我在阅读中会着重关注论文中对数据局限性和数据合理推断的认识。有些研究者会夸大他们的主张,这对我来说可能是一个危险信号。我还会给自己戴上“流行病学家”的帽子,这样我就可以确保研究设计足以实际测试了正在被检验的假设。随着我对论点框架、图形和讨论的深入阅读,我也在思考哪些部分是令我激动人心并具有创新性的,哪些在生物学或逻辑上是相关的,哪些是最受文献支持的。我也会考虑哪些部分符合我预先就有的假设和研究问题。             
——Kevin Boehnke 

我的阅读策略取决于是哪篇文章。有时候我会先浏览一下,看看文章有多少内容是与我所进行的研究相关。如果它直接适用于我当前的主题,除了可能已经熟悉的引言我会仔细阅读这篇论文。但我总是想弄清楚是否有特别的地方或数字需要我密切关注,然后我去阅读结果和讨论中的相关信息。我也会检查是否有我感兴趣的参考资料。有时我好奇地想看看这个领域中有谁或者更有可能没有被引用,看看作者是否选择忽略研究的某些方面。我经常发现补充图形(supplementary figures)实际上提供了最令人好奇和有趣的结果,特别是如果结果涉及到作者没有提及的领域的部分,或者如果他们不清楚或无助于他们对整个故事的解释。            
——Gary McDowell

阅读论文正好给了我一个做阅读笔记的任务,使我成为一个积极的读者,而不是让我的眼睛呆滞在堆积如山的文字上,这只会使我忘记刚读过的一切。例如,当我阅读背景信息时,我会将每篇文章中关于特定主题的信息性句子保存在Word文档中。我会在阅读过程中以写评论的方式写下我所产生的想法或我需要进一步探索的问题。这样在我未来的研究过程中,我只需要阅读这份笔记,而不是重新阅读所有的读过的论文。同样,当我想知道如何进行一个特定的实验时,我会用Excel创建一个表格来总结各种研究团队是如何进行这个特定的实验的。   
——Lina A. Colucci 

我通常从摘要开始阅读论文,这样可以帮助我对研究的全部内容有一个简单的了解。在通读整篇文章之后,如果我发现自己不能在阅读方法部分前理解结果或者是我不熟悉的实验,我则会把方法部分的阅读留到最后。论文中结果和方法部分允许读者分开考虑这篇论文,以确保它经得起科学的严格检验。在阅读过程中我会始终考虑所进行的实验类型,以及这些实验是否最适合解决所提出的问题并且确保作者包含了相关和足够数量的质量控制。通常,结论也可以基于有限数量的样本,这限制了它们的重要性。我喜欢打印出论文进行阅读并在阅读中着重标注最相关的信息,以便于我在重新浏览文章时快速想起要点。我认为与所进行研究最相关的是那些改变对研究主题的想法或者可以给出新的想法和方向的内容。
——Lachlan Gray 

我选择阅读的是基于与我的研究领域,以及那些引起很多兴趣和讨论的东西,因为它们正推动我们在新的方向上研究心理学或更广泛的科学。多数情况下,我试图从论文中得到的是方法论、实验设计和统计分析的问题。所以对我来说,最重要的部分首先是作者用了什么方法,其次是他们发现了什么结果。理解作者为什么认为他们在做这项研究(引言)以及他们认为结果意味着什么(讨论)也是有趣的。当这是一个我非常了解的领域时,我通常不太关心反映作者理论偏好、思考方法及结果的这些章节。但当这是一个我所知甚少的领域时,我会仔细阅读这些内容,因为这可帮助我了解更多该研究领域的假设和解释方法。
——Brian Nosek 

我阅读文章很快。第一次阅读的目的只是为了看看这篇论文对我是否有意义。如果是的话,我会更加注重细节的再读一遍。如果这篇论文对我的研究至关重要——而且是理论性的——我会以重新设计这篇论文的方式阅读。在这种情况下,我只是从起点开始,然后自己解决所有其他问题,而不是通读论文。有时这是一个痛苦而缓慢的过程。有时,我会对作者写得不够清楚、忽略要点、纠缠于多余的废话而感到愤怒。但有时我也会被一篇文章弄得神魂颠倒。  
——Ulf Leonhardt 

我总是先读摘要,只有当摘要表明论文对我有价值时,我才会继续读下去。如果论文的主题是我很熟悉的,我通常会浏览一下引言并阅读它的最后一段,以确保我知道论文中要讨论的具体问题。接着我会看图表浏览结果,最后阅读讨论部分。如果主题不是我熟悉的,我通常会更仔细地阅读引言,以便将研究置于上下文中。最后我再对图表和结果进行阅读。
——Charles W. Fox 

重要的是我们要意识到在阅读论文时必须走捷径,以便有时间完成其他工作,包括写作、研究、参加会议、教学和论文评审。从博士阶段开始,我一直在阅读学术期刊文章和章节的结论和方法,而不是整本书。
——Rima Wilkes 

作为《科学》杂志的总编,我必须一直阅读和理解自己研究领域之外的论文。一般来说,我从通讯编辑写的总结开始阅读,这些总结是为像我这样的人准备的:一个对任何事物都感兴趣但只深入某一领域的科学通才。接下来,我查看是否有人写了一篇关于论文的新闻文章。第三,我查看其他科学家是否有观点。透视的主要目标是拓宽文章的信息,但是作者通常在为非专家学者提取文章精华的同时也做了大量的工作。由于摘要是为了广泛地传达给期刊的读者而写的,因此我会对摘要进行讨论。最后,我继续阅读论文本身,依次阅读引言、结论、扫描图表,然后通读论文。
——Marcia K. McNutt 




当有些东西你不明白时,你会怎么做?



我喜欢在线阅读,这样我就可以轻松地将我不知道的单词剪切粘贴到浏览器中,以了解它们的意思。      
——McNutt 

如果文章里只有一些我不熟悉的东西,我会记下来以后查。如果我真的在努力完成阅读这篇论文,我会试着查阅一篇综述文章或教科书中的章节,以给我提供必要的背景资料,这样我会觉得效率更高。在阅读过程中会遇到许多缩略词和行话,这些内容可能是特属于一些子领域的,所以除非是为了我自己的研究,否则我通常不会涉猎这些细节。不过在阅读论文的过程中,我会努力花时间去理解正在使用的(研究)方法。
——Shanahan 

在阅读中遇到不理解的内容我通常会立即停下来查找。如果我不懂一个关键短语或行话,剩下的阅读可能就没有意义了。然而,这可能会适得其反,因为我经常在阅读过程中向上追溯原因(什么是X?哦,X影响Y……那么Y是什么?等等)。当你去了解事物是如何联系在一起的时候,这可能是一种乐趣,但是如果你的时间紧迫,这可能会把你的注意力从手头的任务上转移开。有时,论文中所有的行话会首先模糊实验的全部要点。在这种情况下,问问你自己“作者试图回答什么问题”?通过这样的方式你可以判断作者是成功还是失败。
——Borniger 

这取决于不可理解的部分在多大程度上阻止了我去关注主要论点。我通常不会在第一次看文章时试图理解所有章节的所有细节。如果不可理解的部分对我的研究很重要,我会试着问同事,甚至直接联系主要作者。因为时间有限,所以回到最初的参考文献获取所有的背景信息是最后的手段。合作或个人直接联系作者在解决具体问题时效率更高。     
——Tubiana 

有时候,你只需通读一篇论文就可以使任何你不熟悉的术语到最后都会变得更清楚。如果进展非常艰难,那么停下来寻找额外的信息通常是解决问题的最好办法。因此我会在Google上快速搜索主题、题目、方法等来协助我获得这些信息。如果这是一篇内容非常密集的文章,那么你需要在阅读这篇文章之前额外阅读几篇文章。
——Gray 

我问自己的问题是,“为了从这篇论文中得到我需要的东西,我需要理解这意味着什么吗?”我现在阅读的研究领域的文章远远超出了我的专业知识范围,我通常不需要更多的实质性内容的肤浅知识。如果我不能理解论文的深度,那我就需要做更多的背景研究否则我就不能做任何事情。
——Nosek 

最近,我不得不阅读一些存在很多不熟悉内容且是我所研究专业领域之外的论文。在某些情况下,我能够直接从结果或图表中提取我需要的信息。我也会使用Google搜索来定义论文中的术语和概念,或者阅读引用的参考文献来更好地理解所提出的观点。有时候论文是如此的不可理解(至少对我来说),以至于我懒得去读它们。
——Fox 




你是否曾觉得阅读论文不堪重负,你如何应对?




如果这篇论文与我正在努力解决的问题有关,你可以肯定论文中有一些关键的东西我不明白。这种混乱不是威胁,而是机会。我是无知的,我需要变得不那么无知。这篇论文可能对我有所帮助。同时,有些论文写得很糟糕,不值得费力去读。其他人肯定已经把概念写得更清楚了,这样我就可以把我的困惑集中在理解实质而不是糟糕的语法上。     
——Nosek 

如果所要阅读的论文不在我所了解的研究领域,如果它的篇幅很长,如果文章中充满了技术术语,我会不知所措。当这种情况发生时,我的解决办法是将文章分成几块,并在接下来的几天内进行阅读。对于真正难以理解的论文,我认为和同事们在一起讨论也很有帮助。  
——Shanahan 

是的,很多次了。这就是为什么我通过与其他科学家交谈和反复试验来制定自己的阅读策略。我曾经也沮丧地举起过双手,扔掉那些讨厌的论文,再也不看。
——Boehnke 

是的,在这些情况下,你必须意识到一些论文是几十位科学家多年工作的结果。期望在一个下午消化和理解其中的所有内容是一个牵强的想法。     
——Borniger 

我常常感到不知所措!但是某些部分可能不需要像其他部分那样深入理解。你还需要知道你自己的短板:论文中是否有一些部分是你想模仿的,但不是你专业知识的一部分,并且可能通过合作变得“可访问”?
——Tubiana

如果我觉得这篇论文对我正在做的事情非常重要,我会暂时放下它,过段时间后再阅读几次。但是如果这太令人难以承受,那么我不得不把它放在一边,除非我联系过的同事中有人能够解释它。     
——McDowell




你还有其他想分享的建议吗?



如果有一篇我想彻底理解的开创性论文,我会想办法做一篇关于它的杂志娱乐式的介绍。谈论特定的论文和回答问题是我学习资料的最好方式。此外,还需要找到一个好的参考文献管理工具。“Mendeley”这个软件可以很好的帮助我做研究、阅读文献及写论文。
——Colucci 

学术界年轻的读者由于没有阅读的参考框架,所以会发现自己阅读论文时很慢。但是有很多方法可以把阅读作为一个创建心理书架的系统,几年后,你就可以很容易地把文章放到你的心理书架上。然后你可以快速浏览一篇论文来了解它的贡献。       
——Wilkes 

你需要耐心点。不要害怕或羞于使用维基百科或其他像博客帖子这样的非专业受众资源来了解你的主题。你需要问很多问题。如果你不能清楚地理解这篇论文,那就和你圈子里的人谈谈。如果你仍然感到困惑就去给作者发邮件。
——Boehnke

不要犹豫与更有经验的科学家交谈。所有的科学家都需要更多的经验将复杂的概念转化为通用术语,因此他们向你解释复杂论文中的概念等内容时也是在帮助他们。              
——McNutt

如果可能的话,经常阅读。试着保存一个参考文献文件,其中包含文章的摘要,任何重要的论点,甚至一两个图形以及引文信息。注意不同的文章结构和不同的写作风格,这将有助于你形成一种既有效又独特的风格。              
——Shanahan 

原文信息:
Elisabeth Pain, How to (seriously) read a scientific paper, Science, Mar. 21, 2016, 
https://www.sciencemag.org/careers/2016/03/how-seriously-read-scientific-paper 
posted in How-To-Advice doi:10.1126/science.caredit.a1600047

被采访对象列表:              
  • Jesse Shanahan,  康涅狄格州米德尔顿卫斯理大学天文学硕士研究生
  • Cecilia Tubiana, 德国哥廷根马克斯·普朗克太阳系研究所的科学家
  • Jeremy C. Borniger, 哥伦布俄亥俄州立大学神经科学博士研究生
  • Kevin Boehnke, 安阿伯密歇根大学环境健康科学博士研究生
  • Gary McDowell, 马萨诸塞州梅德福德塔夫茨大学发展生物学博士后研究员,波士顿学院访问学者
  • Lina A. Colucci, 哈佛-麻省理工学院健康科学与技术项目的博士研究生
  • Lachlan Gray, 布尔内特研究所艾滋病毒神经发病实验室副主任,澳大利亚墨尔本莫纳什大学传染病系兼职研究员
  • Brian Nosek, 弗吉尼亚大学心理学系教授,夏洛茨维尔开放科学中心执行主任
  • Ulf Leonhardt, 以色列雷霍沃特魏茨曼科学研究所物理学教授
  • Charles W. Fox, 列克星敦肯塔基大学昆虫学系教授
  • Rima Wilkes,温哥华不列颠哥伦比亚大学社会学系教授
  • Marcia K. McNutt, 《科学》杂志总编

更多高效阅读论文的参考资料请见以下文章链接:
《READING SCIENTIFIC PAPERS》by Robert Siegel
http://web.stanford.edu/~siegelr/readingsci.htm
《How to Read a Scientific Article》by Mary Purugganan, Jan Hewitt 
http://www.owlnet.rice.edu/~cainproj/courses/HowToReadSciArticle.pdf


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