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Molecular Cancer | 规模作为庞大!南京医科大学陈峰及魏永越全面分析m6A调节因子及互作用编码和非编码RNA

N6-甲基腺苷(m6A)是一种RNA修饰,可与众多编码和非编码RNA相互作用,并在癌症的发展中发挥重要作用。尽管如此,由于大多数研究仅关注单一癌症类型,因此m6A相互作用基因对这些癌症的临床影响在很大程度上尚不清楚。


2021年4月13日,南京医科大学陈峰及魏永越(沈思鹏及张汝阳为第一作者)共同通讯在Molecular Cancer(IF=15.30) 在线发表题为“Comprehensive analyses of m6A regulators and interactive coding and non-coding RNAs across 32 cancer types”的研究论文,该研究全面评估了m6A修饰模式,在9,804个全癌样品中发现23个m6A调节剂和83个交互式编码和非编码RNA。


该研究使用聚类分析来识别m6A亚型,并基于无监督方法构建了m6A身份特征。该研究开发了三种不同的m6A修饰亚型。它们与27种癌症中的24种的总体生存率显著相关。该研究构建的个体水平m6A身份特征与生存率,肿瘤突变负担和经典途径相关。有了身份特征,该研究确定了114个新基因作为潜在的m6A靶标。BCL9L是癌症类型之间最常见的基因,是一种癌基因,可与Wnt信号通路中的m6A模式相互作用。总之,m6A调节剂及其相互作用的基因会影响各种癌症的结果,评估m6A亚型和单个肿瘤的特征可能有助于辅助治疗的设计。


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N6-甲基腺苷(m6A)是一种真核mRNA修饰,可调节基因表达,并通过改变mRNA的稳定性,剪接,转运,定位,翻译,microRNA(miRNA)加工和RNA-蛋白质相互作用。新兴证据表明,m6A修饰与肿瘤增殖,分化,肿瘤发生,侵袭和转移有关,并在癌症发展中起重要作用。

此外,m6A修饰还受众多蛋白质编码基因,非编码RNA(例如miRNA,lncRNA)的调节,进而控制肿瘤细胞的增殖,浸润和转移等过程。但是,很少有研究针对编码和非编码RNA全面评估m6A相互作用基因,这对癌症有很大贡献。在这项研究中,该研究探索了m6A调节剂以及它们在全癌环境中的相互作用编码和非编码RNA。

该研究全面评估了m6A修饰模式,在9,804个全癌样品中发现23个m6A调节剂和83个交互式编码和非编码RNA。

该研究使用聚类分析来识别m6A亚型,并基于无监督方法构建了m6A身份特征。该研究开发了三种不同的m6A修饰亚型。它们与27种癌症中的24种的总体生存率显著相关。该研究构建的个体水平m6A身份特征与生存率,肿瘤突变负担和经典途径相关。有了身份特征,该研究确定了114个新基因作为潜在的m6A靶标。

BCL9L是癌症类型之间最常见的基因,是一种癌基因,可与Wnt信号通路中的m6A模式相互作用。总之,m6A调节剂及其相互作用的基因会影响各种癌症的结果,评估m6A亚型和单个肿瘤的特征可能有助于辅助治疗的设计。



参考消息:
https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-021-01362-2


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