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GraphPad Prism 绘图教程:标准化实验室中的Prism使用

如果你的实验室中有许多人使用GraphPad Prism,那你们可能会想要对一些GraphPad Prism的首选项进行规范化,或者为所有人提供一组模板、方程或配色方案。


本篇文章就给大家讲解如何实现这一点。


#1

锁定首选项文件

首选项文件中包含什么?

Prism在其“首选项”对话框中提供了许多选择。它允许你为配色方案、字体、符号大小、图表单位等因素设置默认值。除此之外,Prism“首选项”文件还会记住你最近打开或关闭的文件、创建的用户自定义方程、创建的配色方案、自动完成文本等。所有这些均保存在为你定制的Prism“首选项”文件中。


首选项文件位于何处?

Windows XP:

[system disk]:\Documents and Settings\[user] \Application data\GraphPad Software\Prism\8.0\Prism8.cfg


Vista和Windows 7-10:

[system disk]:\Users\[user]\AppData\Roaming\GraphPad Software\Prism\8.0\Prism8.cfg


Mac:

~[local user]\Library\Preferences\ com.GraphPad.Prism.plist

使用旧版本OSX时,你可以使用Finder找到文件,并将其拖到回收站。自Lion以来,文件不可见。如需删除,请启动终端应用程序,并输入以下命令:

rm ~/Library/Preferences/com.GraphPad.Prism.plist


如何防止对首选项文件的更改:Windows

Prism用于教学实验室时,你希望Prism每次都以相同方式启动。某学生使用Prism时,你会希望他不使用其他学生设置的首选项,否则会使Prism的操作看起来不可预测。


第一步是创建并写保护首选项文件。

1.从以下位置删除Prism首选项文件Prism8.cfg:

[system disk]:\Users\[user]\AppData\Roaming\GraphPad Software\Prism\8.0

2.启动Prism,以便它创建一个默认的首选项文件。

3.为每名用户设置您想要的任何首选项。

4.创建您希望每个人都能访问的任何配色方案,以及你希望每个人都能访问的用户自定义方程。

5.退出Prism。此时,首选项文件已保存。

6.你可能希望对首选项文件进行写保护,以确保将来不会被更改。


第二步是将/C添加到Prism命令行,告诉Prism退出时不要重新保存首选项文件。

各用户依可对首选项文件进行更改,且将在该会话中使用这些更改。但不会保存这些更改,因此下一名用户不会看到。


如何防止对首选项文件的更改:Mac

上述适用于Windows解释的方法不起作用,因为OSX没有命令行切换。取而代之的是,创建并写保护首选项文件。

1.从以下位置删除Prism首选项文件com.GraphPad.Prism.plist:

~[local user]:Library:Preferences

2.启动Prism,以便它创建一个默认的首选项文件。

3.为每名用户设置你想要的任何首选项。此外,还可以创建任何配色方案或用户自定义方程,让每个人都可以访问。

4.退出Prism。

5.写保护首选项文件:

打开包含首选项文件的文件夹:~[local user]:Library:Preferences

请注意,Mac具有多个库文件夹。在本地用户中选择每个学生将要登录的文件夹,而非整个库文件夹。

右击文件"com.GraphPad.Prism.plist",然后选择“获取信息”。选择“锁定”。

对包含自动完成文本条目列表的文件:com.GraphPad.Prism.autocomplete.plist,重复该操作。


#2

个人首选项文件

Prism在配置文件中存储有用户定义的方程列表、首选项对话框中的选项、最近使用的文件列表等。

Prism Windows将首选项设置存储在Prism8.cfg文件中。Prism Mac将首选项设置存储在名为“Prism 6首选项”的文件中。这些文件的位置取决于您所使用的Windows或Mac OS版本,因此请搜索这些文件的位置。

如果多人共用一台Windows计算机,则每个人可能希望保持自己的首选项和方程。为此,请为每名用户创建不同的快捷方式图标。在快捷方式属性对话框的目标部分,输入Prism程序的完整路径名,后跟“-O”(字母O,不是零),然后输入想要使用的配置文件的完整名称。如果文件不存在,Prism将创建文件。例如:

C:\Program Files\PRISM8\PRISM.EXE -OC:\JERRYS\JSPRISM.CNF

如果你正在运行网络许可证,可以将Prism6.cfg文件放入共享(服务器)驱动器上的程序文件夹中。在新计算机上首次使用Prism时,它将使用此共享配置文件中的设置。更改将保存在各用户的硬盘上。这意味着所有用户都可以从相同的设置开始,然后进行自定义设置。


#3

共享模板、方法及示例

GraphPad Prism也可以帮助你确保每个使用Prism的人均看到相同的模板、方法和示例。在一台计算机上创建模板,然后将文件移至您管理的其他计算机上。但是,你需要知道存储文件的位置。


模板

模板是完整的Prism文件,你将在“欢迎(文件..新建)”对话框的“打开文件”选项卡上看到这些文件。你可以在“首选项”对话框的“文件位置”选项卡中告诉Prism保存模板的位置。默认位置如下所列。

Prism在以下位置保存模板:

[[system disk]:\ProgramData\GraphPad Software\Prism\8.0\Templates\[templates category folder]


Prism Mac在以下位置保存这些文件:

Users/[User]/Library/Application Support/GraphPad/Prism/8/Templates/[templates category folder]


方法

方法文件包含数据表和链接分析与图表。应用一种采用Wand(分析数据向导)的方法时,这些分析和图表会附加至新数据表。

Prism Windows在以下位置保存方法:

[system disk]:\ProgramData\GraphPad Software\Prism\8.0\Methods\[methods category folder]


Prism Mac在以下位置保存这些文件:

/Library/Application Support/GraphPad/prism/8/Methods/[methods category folder]


示例

示例文件是一种具有链接数据与分析的Prism图表。你可以克隆“欢迎”对话框的“克隆图表”选项卡中的示例。


保存的示例

Prism Windows XP在以下位置保存示例:

[system disk]:\Documents and Settings\[User]\Application Data\GraphPad Software\Prism\8.0\Examples\[examples category folder]


在Vista或Windows 7上,Prism在以下位置保存示例:

[system disk]:\Users\[User]\AppData\Roaming\GraphPad Software\Prism\8.0\Examples\[examples category folder]


Prism Mac在以下位置保存这些文件:

/Users/[User]/Library/Application Support/GraphPad/prism/8/Examples/[examples category folder]


共享示例

“欢迎(文件..新建)”对话框克隆选项卡为共享示例提供了单独的选项卡。这些示例是打算在实验室中创建的示例,将与实验室中的每个人共享。在该选项卡上显示图表的唯一方法是手动将文件从保存的示例文件夹移至共享的示例文件夹。


Windows XP上,Prism在以下位置查找共享示例:

[system_disk]:\Documents and Settings\All Users\Application Data\GraphPad Software\Prism\8.0\Examples\


Windows Vista或Windows 7上,Prism在以下位置查找共享示例:

[system_disk]:\Users\All Users\GraphPad Software\Prism\8.0\Examples\


Prism Mac在以下位置查找共享示例:

Library/Application Support/GraphPad/prism/8/Examples


此外,Prism Mac还在应用程序包中寻找共享示例:

[Prism.app]/Contents/SharedSupport/Examples


为方法和模板提供在线帮助

保存模板或方法时,请输入简要描述。如果你想要为你的用户提供更多帮助,还可以创建网站(.htm)文件,其中解释模板或方法的使用方式。向该文件给予与模板或方法相同的名称,但带有扩展名.htm,并放在同一个文件夹中。例如,如果你的模板是doseresponse.pzt,则创建名为doseresponse.htm的帮助文件。有人使用模板或方法时,Prism会弹出具有简要说明的对话框。该对话框还有一个按钮“帮助该模板”。点击该按钮时,Prism将启动Web浏览器,显示你已创建的.htm文件。


#4

添加你们自己的内置方程
我们也可以在Prism中添加你自己的方程,这些方程将出现在“用户定义的方程”组中。但是,如果你想与实验室内的其他人分享一组用户定义的方程,你可以创建一组新的方程,将其列于我们提供的方程下侧。目前仅Prism for Windows提供有该功能。

如何创建新的方程文件:
1.开始一个新的Prism项目。转至“首选项”、“文件和打印机”选项卡,并确保您正在保存.pzf格式,且未选中“保存压缩文件”选项。
2.对于每个方程,抑或使用非线性回归拟合数据集,抑或模拟理论曲线(绘制函数)。将结果页面重新排序为你希望方程在方程列表中显示的顺序。
3.如果用户选择你的方程并点击“详细信息”,他们将会看到一个链接至该方程的小预览图表。确保该小尺寸图表容易理解。
4.输入每个方程时,也要考虑输入描述和提示。该提示出现在非线性回归的“拟合”选项卡上。描述显示在“详细信息”页面上。
5.保存方程时,请使用类似以下名称的名称:“[Smith Lab]流式细胞术方程”,因此所用Prism使用者都很清楚,这些方程并非来自GraphPad(我们无法回答有关它们的问题)。
6.请注意,你创建的每个文件均将成为Prism中方程的“文件夹”。因此,你的每个文件均需包含若干方程。

如何使这些方程与内置方程列表一起出现:
  • 将文件移动(或保存)到“Prism”程序文件夹中的“方程”文件夹。
  • 请勿删除Prism附带的任何方程文件。由于其采用“内置”方式纳入,因此应一直可用(防止后期出现混淆)。
如果Prism正在运行,则退出,然后重启。现在,你将在非线性回归的“拟合”选项卡中看到你的方程列表。

如果需要编辑这些方程:退出Prism,并将文件移出“方程”文件夹;重启Prism,打开文件并编辑。完成后,保存你所作更改并退出Prism。最后,将文件移回“方程”文件夹,并重启“Prism”。

别担心.pze文件
对于每个“内置”方程文件,Prism可创建一个.pze文件。这些文件本质上包含编译好的方程,因此Prism可更快地加载方程。使用Windows系统时,可以在应用程序数据文件夹中找到这些内容。
你无需管理这些文件,也不应该试图这样做。必要时,Prism会自动创建并更新所需的文件。


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